1、慢性阻塞性肺疾病：
血府逐瘀丸是行气活血的代表方剂，具有化瘀袪痰、止咳平喘的功效。方中桃仁破血行滞、红花活血
袪瘀，二者共为君药。赤芍清热凉血，祛瘀止痛；川芎祛风止痛，活血行气；牛膝引血下行，活血通络，三药共为臣药，辅助君药活血祛瘀。生地黄、当归养血和血；枳壳、桔梗宽胸行气、止咳化痰；柴胡疏肝解郁，与桔梗、枳壳同用，理气行滞，上述5味药物共为佐药。甘草益气补脾、止咳化痰，协调诸药为使。现代药理学分析表明：桃仁中的苦杏仁苷、红花中的红花苷具有舒张血管、增加纤溶活性与抗血栓功效，兼有抗炎、镇静的作用；赤芍中的芍药苷、川芎中的川芎嗪、牛膝中的磷酸镁，具有扩张肺部毛细血管与小动脉，抗血小板凝集，改善机体微循环的作用；生地黄中的有效成分能强心、利尿，增加细胞免疫的功能；当归中的阿魏酸能改善外周循环，兼有镇静作用；枳壳可兴奋胃肠道平滑肌，又可降低胃肠道平滑肌张力。桔梗中的皂苷能反射性促进气道分泌黏液，从而稀释痰液，使之易于排出。柴胡皂苷具有抗炎、解热、镇痛、镇咳等作用。甘草黄酮止咳祛痰作用明显。
血府逐瘀丸辅助治疗慢性阻塞性肺疾病，能促进肺部微循环、减轻炎性反应，改善肺功能与血液氧合。
2、冠心病心绞痛：
血府逐瘀丸方中生地和血养阴；桔梗化痰理气散结；甘草调和诸药，引药入经；枳壳理气行气，一升一降，调整气机；柴胡疏肝。根据现代药理学研究，川芎、丹参、当归可抑制血小板聚集，抗血栓形成，促进纤溶，扩张冠状动脉血管，改善微循环；丹参、川芎能够清除氧自由基和抗脂质过氧化，增加心肌供氧。血府逐瘀丸主要起到活血化瘀，通络止痛作用。血府逐瘀丸治疗冠心病心绞痛，可改善患者，降低发作频率，改善型心电图缺血表现。
3、高脂血症：
血府逐瘀丸方中当归、川芎、红花、桃仁化浊瘀降脂为主药；牛膝祛瘀而下行通利血脉，取其“气为血帅，气行则血行”之意；配柴胡疏肝解郁，理气及缓解压力，舒畅情志。枳壳、桔梗宽胸行气，则气血通畅；生地凉血清热、祛瘀；甘章调和诸药。共凑活血，祛瘀疏肝，解郁理气降脂之功效。现代药理学研究表明，血府逐瘀丸具有扩张血管、改善血流、抑制血小板聚集，改善微循环、抗凝、降血脂、抑制动脉硬化、调节植物神经功能等作用。
4、高血压：
血府逐瘀丸为中医活血化瘀名方，由桃红四物汤合四逆散加桔梗、牛膝组成。方中桃红四物汤活血化瘀，四逆散疏肝理气，桔梗开胸膈结气，牛膝导瘀血下行。该方主治胸膈瘀血病变，同时对全身血瘀气滞证也具有良好疗效。现代临床应用该方治疗心血管疾病多见，临床只要辨证有瘀血表现，均可采用本方作为主方或副方进行加减治疗，疗效颇佳。试验表明，本方中当归、桃仁、红花、赤芍、川芎等活血化瘀类药物均可品著抑制血小板功能，拮抗多种诱导剂所致血小板聚集，延缓血液凝固，促进血栓溶解，显著改善血液流变性等，从而改善血瘀证高血压患者的血液系统，因此对从根本上调节血管张力系统、降低血压、维持血压稳定性有明显作用。
血府逐瘀丸辅助治疗高血压，可起到提高降压效果、稳定血压水平的作用，尤其对患者血管内皮功能有改善效果，可增加血清NO浓度和降低血浆ET-1 水平。
5、失眠：
血府逐瘀丸由四逆散(枳实易枳壳）合桃红四物汤加桔梗、川牛膝而成。桃红四物汤养血活血，行气化瘀；四逆散疏理肝气，使血行无碍；桔梗配牛膝使气血升降有序，三焦内外、左右、上下皆通。诸药配伍，养血活血，行气化瘀，升降有序，使三焦通。现代医学认为，失眠可使毛细血管狭窄、痉挛，引发大脑皮质缺血、缺氧，而血府逐瘀丸可改善颅内细血管通透性，增加氧储备。
6、脑梗死：
血府逐瘀丸用桃仁、红花、川芎、赤芍活血袪瘀，配合当归、生地活血养血，使瘀血去而又不伤血；柴胡、枳壳疏肝理气，使气行则血行；牛膝破瘀通经，引瘀血下行，桔梗入肺经，为诸花舟楫引药上行，牛膝引瘀血下行，一升一降，使气血更易运行；甘草缓急，通百脉以调和诸药。
现代药理研究表明，桃仁具有抗凝血、抗血栓等作用，对心肌缺血损伤和脑部血管活性有改善作用。当归具有抑制血小板聚集、抗凝作用。红花具有扩张冠状动脉作用，可改善动脉的血流量，降低血管阻力，有抗血小板聚集、抗血栓作用。川芎的有效成分川芎嗪和阿魏酸等具有清除氧自由基、减轻
Ca2+超载、保护血管内皮细胞、扩张血管、抑制细胞凋亡和肥大、调节免疫状态、抗血小板聚集和血栓形成，影响多种细胞因子的表达等作用，从而能针对多系统、多器官、多种病证发挥作用。赤芍能抑制脂质过氧化反应，对局灶性脑缺血再灌注损伤有保护作用，能使脑组织梗死面积减少，显著提高缺血脑组织中Na+-K+-ATP酶、Ca2+-ATP酶的活性，改善梗死后脑组织的能量代谢。诸药相合，临床上可控制梗死面积，保护心脑血管和细胞，改善神经功能。