台剧《谁是被害者2》讲述了前调查员方毅任（张孝全饰）与记者出身的公关经理徐海茵（许玮甯饰）带着女儿江晓孟（李赛凤饰）开始了新的生活。然而，方毅任却卷入了一系列死亡事件，成为头号嫌疑人。这些事件与他
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年前接手的一起谋杀案有关。检察官张耿浩（藤冈靛饰）怀疑方毅任和他的导师林景瑞有所隐瞒。方毅任与探长赵承宽（王识贤饰）和法医薛欣宁（苏慧伦饰）合作，揭开真相，证明自己的清白，否则他将面临再次与江晓孟关系破裂的风险。
台剧《谁是被害者2》第1集分集剧情
方毅任参加了林景瑞的葬礼后，留下了”E=MC2″符号，引起了远方检察官张耿豪的注意。随后，方毅任被召回警局参加一个名为“重启调查”的会议，询问有关2008年萧家颖和陈央宇两名高中生情侣的案件。当年，警方的报告称他们在旅途中发生争执，萧家颖拿出手枪杀死陈央宇后自杀。由于嫌疑人已经死亡，案件被结案。然而，萧家颖的母亲萧敏君多年来一直认为警方的调查与事实不符。最近，验尸官发现当年两具尸体上有异常多的蜣螂粪便，怀疑是死后才沾上的，加速了尸体的腐烂，导致警方误判死亡时间。因此，萧家颖的死因不再是自杀的推断，张耿豪认为有人故意影响了尸体，萧家颖可能是被他杀。
方毅任否认林景瑞有问题。后来，他收到了萧敏君的短信，她强调女儿不是自杀，并提供了证据指出林景瑞存在问题。方毅任被约见在停车场，但萧敏君却不见了。就在他离开时，萧敏君从停车场堕下，方毅任突然成为凶手嫌疑人。方毅任被扣查时，报告中也指出萧敏君可能是被他杀害的，使他的嫌疑加重！张耿豪坚信方毅任犯下谋杀罪以掩饰当年的失误。对方毅任来说，这个一季确实不太好过。
萧敏君死前向电影台送匿名信，指控袁绮翎15年前犯下谋杀和弃尸罪，附有《去我们的远方》清唱音档和当年案件剪报。警方问询袁绮翎但无线索。法医在萧敏君的指甲上找到方毅任的皮屑，推断她在星期三的上午10:00到下午2:00之间死亡。然而，方毅任与萧敏君从未见面。方毅任与赵承宽延迟提交资料，寻找不在场证据。他们发现15年前袁绮翎不在琴房的记录是伪造的，并将袁绮翎的DNA与案件证据比对，发现一致性。此外，他们发现萧敏君堕楼当天的直播是虚假的。方毅任独自前往袁绮翎音乐会现场，发现袁绮翎已被杀害，颈部插入录音机播放《去我们的远方》清唱。方毅任再次陷入凶手的圈套。
台剧《谁是被害者2》第2集分集剧情
时间回到2007，一名女生与袁绮翎关系要好，但萧家颖加入后。回到案发现场，方毅任听到凶手逃走位置，当想上前追查时，因好有人报案，被张检现场看到他，马上找人捉拿他，被当嫌疑人方毅任再次被信任他的赵承宽解围，暂时逃走。方毅任无法回家潜入赵承宽家中，一起调查，并从可信的法医口中得知袁绮翎生前有被针孔注射痕迹，方毅任认为凶手下刀十分精准，避开会快速死亡射颈动脉，似乎是故意要放血慢慢死去，喉咙的伤口、声带、甲状软骨完全被移除。似乎被凶手带走。
江晓孟不想再读书，及父亲一起住，透过海茵介绍，来到七叶基金会一个收纳有问题无家可归的小孩，创办人林明诚（刘俊谦饰）发现海茵卡片，邀请她过档来七叶基金会。另一方面警方去找袁绮翎妈妈，得知她与妈妈因走的音乐道路不一样而关系变差，此时袁绮翎妈妈收到袁绮翎尸体被切走的部份。方毅任找晓孟，叫她暂时不要回家，令她很错愕，方毅任不愿告诉晓孟发生什么事。方毅任留意到晓孟手机壳，得知是刘书姸设计。方毅任去找刘书姸的，却遇张检到，赵组长马上去请法医帮助接走他。
方毅任与法医去刘书姸老家，偷偷潜入找到笔记本，及相机。同时发现图案有密码，解密后得到了密码，看到十五前一群学生旅行相片，相片中已有三人遇害，包括萧家颖、陈央宇、袁绮翎。方毅任与赵组长前往警局，通知张检相中都是凶手目标，而下一个目标是刘书姸。然而此时已收到恶号电话。
台剧《谁是被害者2》第3集分集剧情
时间回到过去，学生时期方毅任被欺凌怪胎并涉及一宗打斗案，有幸得到恩师帮忙才能帮才能解开真正凶手是谁。回到现在警方收到电话，指刘书姸已离世。张检暂时相信方毅任，大家前往案发现场，看到刘书姸被凶手残酷对待，划去双眼，同样地令死者慢慢流血痛苦而死。为了找出相中其余人身份，方毅任提出到刘书姸丧礼等待凶手出现，果然凭借相中手中伤疤，吴俊律出现，方毅任捉到他，但他否认自己是凶手，并说是“林明诚杀了郭昕白”，后来吴俊律成功逃走。吴俊律所结的白金上也写着“林明诚是凶手”。而林明诚就是方毅任恩师林景瑞儿子。
警方前往七叶基金会寻找创办人林明诚。方毅任意外发现女友海茵转职到该基金会担任公关，二人之间沟通不足引起嫌隙。警方询问林明诚是否见过吴俊律，但他否认并表示吴俊律的指控是出于报复心理。他透露吴俊律有吸毒前科，多次进出戒毒所，曾和他一起建立基金会，但后来他再次沉迷毒品。吴俊律的前女友郭昕白也是药瘾者，在五年前去世后，俊律一直无法接受，因此他请求俊律离开。
林明诚回想起俊律曾说“你爸爸一直在害我”。海茵在对于林明诚没有向警方坦诚见过吴俊律，感到好奇，去查问林明诚，林明诚指否认是因为相信俊律不会杀人，不想背弃他，感觉这回答一分勉强。方毅任从张检口中得知五年前她死于非命，而负责她案子的人也是方毅任恩师林景瑞，张检警告方毅任不要再接触案件。方毅任从法医取得报告，得知当年郭昕白药头起了纠纷，药头持枪杀害了她，但由于案发现场没有监视器，也没有击证人，所以没有找到凶手，方毅任发现案件有问题，郭昕白枪击后被人注射了物品，但当年报告却没有提及。
警方在吴俊律家中发现了子弹，但没有枪，并在CCTV发现吴俊律曾找过林明诚，得知林明诚说谎。警方马上前往七叶基金会，而基金会活随即开始，却不见了林明诚踪影。海茵曾听到林明诚接电话，猜测吴俊律去了林明诚家，便自行开车前往，方毅任尝试打电话阻止海茵行动不果。镜头一转，林明诚回到家中，俊律已持枪等候。一声枪声响起。
台剧《谁是被害者2》第4集分集剧情
俊律持枪指控他杀了很多人，开了枪射向林明诚，刚好海茵到达在林明诚家楼下，上去发现林明诚手擘中了枪，俊律已离开。海茵帮忙急救，林明诚趁着海茵不为意马上收起了家中镜头USB。翠日海茵被警方问话，回到基金会，林明诚感激海茵没有向警方多说话，去质问林明诚是否与凶杀案有关，林明诚急急收起USB被海茵注意到，林明诚希望海茵相信他。林明诚离开后，海茵潜入林明诚房间，偷走了USB，却不知道林明诚已透过监视器发现了。预事海茵将有重大危险。
江晓孟去找父亲，但手机没电，被薛法医注意到。薛法医知道江晓孟是命案现场的清洁工，关心他并给予止呕药物，提醒他要珍惜当下并提醒不能忘记自己是人。警方追捕吴俊律，赵组长和方毅任在化验室会面。发现两起案件的弹壳上的枪击痕和弹头相符，显示使用了同一把枪。但萧家颖案的枪应该在15年前被送入证据库，不应该出现在5年前的郭昕白案中。法医发现两起案件中使用的枪的指纹已被清除，整把枪看起来像是被清理过，显示有人从证据库中拿走了萧家颖的枪，并用来杀害了郭昕白。证据显示可能是警方内部的人所为，并有人模仿赵组长的笔迹做了拿枪的纪录。所有线索指向方毅任的恩师，也就是林明诚的父亲林景瑞。
警方前往七叶基金会搜证，海茵向林明诚展示手中的USB，声称是警方所需的。海茵不信任林明诚，他则声明自己无罪，欢迎海茵将USB交给警方。吴俊律回忆着郭昕白中枪受伤的情景，为她注射药物。他收到匿名短信提到基金会的萧仓会交代郭昕白的事情。然后镜头切换，吴俊律被杀害，被或走了身体一些组织。在警局里，有人向张检施加压力，提醒他会长已经没有耐心了。张检偷偷潜入化验所，偷走了重要物品。
方毅任找退休的罗警长，他是当年林景瑞的下属，参与萧家颖和陈央宇案，而罗警长则是江晓孟的老板，发现与案件有关的东西。罗警长毫不犹豫地将当年的纪录交给方毅任，这份纪录在警方原有的文件中并不存在。方毅任约法医到现场重组案情，发现陈央宇的鞋子上有萧家颖的血迹，推翻了萧家颖自杀的可能性。方毅任猜测当年可能有第三个人帮助陈央宇穿上鞋子，以双环结绑鞋带，与他的恩师一样的绑法。他推断现场不是第一案发现场，而鞋子被穿回去是为了掩饰萧家颖和陈央宇死后被带到树林的事实。
台剧《谁是被害者2》第5集分集剧情
回忆到15年前，萧家颖和朋友一同旅行，彼此间有着深厚的友情。警方在基金会仓库中发现了吴俊律的尸体，他的口部大量出血并逆流进肺部，造成窒息的痛苦死亡。在现场发现了萧敏君给方毅任的照片中的一枚对戒。推测另一枚戒子原本在郭昕白手上，但实际上在林明诚手中。海茵对林明诚感到不信任，找到他希望他坦白一切，证明自己的清白。张检从法医柜中偷走的证物是萧敏君案中的，在指甲碎片中发现了方毅任的DNA，但薛法医并未提供这个证据。
警方无法找到另一枚戒指，所有的证据都指向林景瑞。赵检和法医希望方毅任揭露真相。最终，方毅任坦白承认，他当年未能完成萧家颖案的鉴识工作，由林景瑞代替完成。林景瑞鼓励他保护家人，不要牺牲自己。方毅任对林景瑞非常信任，因此在鉴识报告上签了名字。江晓孟将袁绮翎凶杀现场清洁时发现的袁绮翎的生前日记本还给了她的母亲，但袁绮翎的母亲拒绝接收。江晓孟对袁绮翎的母亲表示感谢并安慰了她的心灵。林明诚前往警局，将郭昕白的戒指交给警方，表示有人故意陷害他。赵组长质问当年案件，萧家颖和陈央宇并不是情侣一起出游，而是7人一起出游，而林明诚就是拿相机的第7个人。林明诚坦白他们都是他的朋友，当年大家想逃离家庭，偷了公车去旅行，之后因脚伤而回家，否认自己犯下杀人罪。海茵利用她的记者人脉暗中调查林明诚。
江晓孟在袁绮翎的生前日记中发现了一份路线图，描述《去我们的远方》中提及了15年前7人旅行的行程。她想向父亲方毅任提供这个线索，但方毅任却严厉地告诉她不要涉入此事。在大雨中，晓孟独自跟着路线图发现了一些线索，但因发高烧而晕倒送医。与此同时，赵组长得知张检已经找到法医却没有上交报告，方毅任的DNA证明了他与萧敏君案有关，赵组长打算正式起诉他。林明诚拿着他与萧家颖的合照，回忆起当年的事情，他曾经暗恋萧家颖，他把证据烧掉，但被海茵发现，她及时拿走了相片并找到了钥匙。晓孟醒来后解释了她去山上的原因，她认为自己对已故的人有责任，当她在歌词中找到线索时，她想要弄清楚整个案情。她坦白自己是一名命案现场清洁师，希望理解那些已故者，并帮助他们的家人做些事情，因为她对自己为何而活感到困惑。晓孟向他展示了山上的现场画面，这些与歌词和书姸的画作有关。
警方找到了当年被盗的公车，是716线，但公车已经消失了，方毅任根据记忆想到了书姸父亲家中有718线的公车。书姸父亲告诉他们，当年书姸高中时离家出走，被警察带回来，并得知她和一群离家的朋友偷了公车。书姸父亲请求警察不要报案，警察答应了并让书姸父亲销毁了公车，以销毁证据。书姸当年受到惊吓，请求父亲偷偷藏起了那辆车。薛法医和方毅任一起检查了公车，方毅任在公车上发现这才是陈央宇死亡的第一案现场。在质问中，书姸父亲认出当年的警察就是林景瑞。
台剧《谁是被害者2》第6集分集剧情
林明诚心里读白解释当年案情，在15年前旅行，各人开始想回家，林明诚看到他喜欢得萧家颖感到难过，此时被发现藏有枪令大家震惊，急忙下拿起枪来指向大家，大家被吓到，在争执下杀死了陈央宇。回到现场薛法医与方毅任查在716公车搜证，方毅任发现这是第一案发现场。薛法医被现场画面震撼晕到送院。方毅任送她到医院，此时晓孟收到爸爸送的新鞋，致电感谢，并发现薛法医住院便前来探望。大家都希望方毅任认清是林景瑞伪造证据，方毅任不愿相信。海茵把从林明诚取得的与萧家颖合照及钥匙给了方毅任，让他查清楚事情。
赵组长趁张检不在，偷走了证明方毅任杀萧敏君的DNA文件时发现另一份文件，于是致电某人希望见面，结果发现哪人是凶手被枪伤，昏迷。张检质问方毅任到底查到什么，为何一直被凶手盯上。方毅任于是分享了他查到公车是陈央宇死的第一案发现场，认为当时林明诚就在现场，他交出海茵所找到的属于林明诚钥匙及照片，让张检去查钥匙用途。最后查到是陈央宇的塔位钥匙，方毅任发现塔位后方曾放东西但被拿走，估计是寄死者信物。根据纪录，郭昕白死的时候，萧敏君曾来过此。
海茵与方毅任去质问林明诚15年前的事，得知已查到公车是第一案法现场。林明诚坦白当年在抢枪过程中导致萧家颖、陈央宇死亡，便找来当警察的父亲帮忙，父亲林景瑞帮教他们伪造证据，隐藏真相，假装成萧家颖杀陈央宇后再自杀，更利用动物粪便加快尸体腐烂，帮他们制造不在证明。而林明诚处理证物时偷偷拿走与萧家颖照片，而在埋走证物时被郭昕白看到。五年前郭昕白想说出真相，把证物挖出来后藏在陈央宇的骨灰龛位中，并告诉萧家颖妈妈萧敏君，让她拿走，林明诚把此事告诉父亲林景瑞，没想到郭昕白因此而死。林明诚否认杀了其他人，并承诺会去自首。
方毅任发现萧敏君遗体有问题，发现遗体已被火化，更有张检来盖章，张检否认自己有盖章。方毅任再次查看萧敏君死亡当天的衣物DNA，发现并不是属于萧敏君的。方毅任无法打通给薛法医，方毅任向张检回报薛法医有问题，而张检从薛法医的保险资料中找到，十年前投保的保险受益人是萧敏君。而赵组长出意外前也拿走了这份资料。方毅任推论萧敏君根本没有死。另一边江晓孟来医院探望薛法医，却发现已出院，并留下了住所，护士请转交，晓孟来到薛法医家，却发现案件资料，以及自己、父亲及海茵等资料都被写在板上，十分可疑，而此时薛法医就站在她身后。方毅任等人马上前往时薛法医家中，镜头一转林明诚在教堂一直等待某人出现了“你来了”，而此人正是薛法医，她拿起枪指向林明诚。
台剧《谁是被害者2》第7集分集剧情
萧敏君自白的影片中，认为女儿被诬陷捏成杀人凶手，还被抛弃在山上，她希望那些参与的人都被惩罚。方毅任等人来到薛法医家，证明了薛法医伪造证据。现场也找到了晓孟的指纹，知道晓孟曾来过。不过幸好晓孟没有受到任可伤害。不过林明诚被薛法医捉走，并要他录影说出自己罪行，并被刀割入心脏慢慢放血，生死未卜。所有死者生前认罪的影片被寄到电视台，事件再被受关注。
晓孟得到方毅任真传，在薛法医家中拍下了一些证据，找到了新发现萧敏君和萧家颖小时候的照片，而照片背景与林明诚被捉后自白的影片背景一样。晓孟猜哪是和萧敏君和萧家颖曾住过的地方，父女二人同时发现是三龙市。晓孟展示袁绮翎日记，认为日记本出现的花出现很奇怪。方毅任认出哪是公车上画的花。为了找出地址，来到薛法医之前工作的医院，然而资料中却是薛法医离职原因是病故。之于萧敏君也曾在医院工作，晓孟发现照片中萧敏君的伤疤与薛法医一样。证实他们认识的薛法医就是萧敏君。为了帮萧敏君报仇，薛欣宁放弃了癌症治疗，让萧敏君在把薛欣宁死后，整容成已故薛欣宁的样子，顶替他的身份。
十五年前真相是林明诚错手杀了陈央宇，大家想送他到医院，萧家颖想保护林明诚抢去枪指向各人。各人反击想抢走萧家颖的枪，结果在过程中让萧家颖窒息至死。方毅任太危险脱离家人，找到林明诚却被薛欣宁捉走。警方来到现场，只看到林明诚尸体。晓孟、海茵来到担心方毅任安危。萧敏君要方毅任就拍道歉及真相影片。方毅任告诉她，至少让他告诉萧家颖最后去了哪。
台剧《谁是被害者2》第8集分集剧情
15年前，萧家颖逃家时曾经打电话给妈妈，事实上萧敏君这个妈妈也很不安，因为萧家颖是很想念爸爸，所以偷偷留着爸爸给她的信，这被妈妈发现后，妈妈认为萧家颖是认为待在爸爸身边会更幸福，所以在萧家颖的内心中，她觉得妈妈就是这样的不安让她感到压力很大，所以每次当萧家颖不管怎么做，妈妈都还是会质疑萧家颖，因此在离家的时候，妈妈接到萧家颖的电话，只有斥责萧家颖，这才会让萧家颖更伤心，甚至在这场逃家之旅绝对不想再回去。
时序回到现在，方毅任被萧敏君给绑架，镜头面前方毅任坦承自己在15年前的萧家颖案件的疏失和过错，也坦承自己现在终于相信林景瑞一开始就对案件动手脚，方毅任一直拒绝相信真相，是因为林景瑞是唯一了解他的人，如果他相信的林景瑞都犯了这样的罪，那在方毅任心中的林景瑞就会消失，方毅任也就会找不到自己存在的意义，更没有自信活着，方毅任只不过是想要了解别人，也希望别人了解他的怪胎，但方毅任其实也还没想到，这15年来，他也没有主动了解过萧敏君所承受的痛苦，如果受害者换成是晓孟呢？
方毅任知道15年前没有办法给萧敏君真相，但至方毅任至少可以告诉萧敏君，当初萧家颖去了哪里。此时，晓孟和徐海茵看着方毅任的影片，两人发现影片背景有船的汽笛声，因此知道方毅任一定是在靠近港口的地方，从最后联络的电话以及影片上传时间，他们找出最有可能的港口），可是赶到现场时，方毅任已经不在，晓孟认为一定是被萧敏君给带走。萧敏君想着自己当初带着萧家颖逃离前夫的回忆，当她看到萧家颖还留有前夫的习惯与回忆时，她都会生气，这也导致萧家颖很怕在妈妈面前说错话让妈妈伤心。
晓孟觉得方毅任可能是会被带去一个跟萧家颖有关的地方，就是日记本中一直提到的重生之地，因为萧敏君最想知道的应该也是萧家颖为什么要离开她，晓孟讲着以前她总觉得方毅任根本不懂她，但现在她理解到其实方毅任其实没有不懂她，而是晓孟自己也没有想过要去理解方毅任，徐海茵有同感最近方毅任确实开始有点不一样了～方毅任说萧家颖与袁绮翎写的日记提到重生之地，是想要跟最爱的家人重新开始，所以把关于爸爸的东西带来这里，其实萧家颖想要重生的人是爸爸。
方毅任马上理解萧敏君对前夫做了什么？萧敏君当然很震撼，因为一直以来对萧家颖付出的是她，过去萧敏君被前夫给家暴，所以竭尽所能带萧家颖离开这个可怕的家，然后就对前夫动手，并且埋在那个家的后院。现在萧敏君很震撼原来萧家颖早就知道是她杀了爸爸，当初目睹一切的萧家颖内心有着对父亲的愧疚，但又想要保守妈妈的秘密，才会希望爸爸重生，萧敏君不能接受这样的真相，于是对方毅任开枪，她被復仇的憎恨给蒙蔽了理性。此时徐海茵和晓孟来到现场，晓孟对萧敏君讲出萧家颖在日记本里想对妈妈说的话。
但这只是晓孟的暂时声东击西，希望徐海茵可以先让方毅任被送医院。萧敏君抓走晓孟，并往隧道里走。晓孟知道重生之地其实是萧敏君告诉萧家颖的，萧家颖并不是想要让爸爸重生，而是要把关于父亲的一切都留在这片土地上，然后最后看爸爸一眼，穿过隧道后，就回到萧敏君身边。现在，萧敏君才惊觉自己也是个该死的人，因为萧家颖一直在替她受着秘密，才害女儿这么痛苦，当萧敏君想要了结自己时，方毅任直接扑向萧敏君，他想要萧敏君给她自己一个机会。
案件过后，方毅任跟晓孟还是分开住，但这是他们都同意好的，方毅任不做控制狂父亲，晓孟也会随时跟方毅任保持联繫和找机会联络感情，两人会用文字来下一些关心和交流，晓孟也渐渐地看见方毅任的改变，徐海茵当起七叶基金会的执行长，方毅任偶尔会去帮忙，他跟徐海茵确认两人的关系，也喜欢现在这样的和谐与稳定。而晓孟认为现在的自己是从漆黑中走出来看见阳光，感觉到自己活着对别人是有意义的，她理解到生命不总是明朗，有时候会让人陷进漆黑的黑洞里，但身边发生一些微小、微不足道的治癒剂，还是会让人看见阳光。
晓孟学会了开车，带着方毅任去妈妈喜欢的那个海边，两人一边敞开心胸试着瞭解彼此，拉近父女的距离，然后勇敢地聊起妈妈/妻子在他们回忆中的过去，方毅任讲着1998/6/14他参加完指纹鑑定班的训练之后去咖啡店，然后因为拿错咖啡而认识彼此。张耿浩跟副座见面，他也很明白地对副座讲到林景瑞案只是个开始，他认为林景瑞能做到这样的程度，警界背后一定有人在掩护他，张耿浩的意思很明白，他这个检察官肯定会跨进警界，平霖市史上有七大未解悬案，每起悬案背后都牵扯许多不可告人的秘密，林景瑞掩盖案件的罪行只是冰山一角，张耿浩是三十年前某起悬案唯一目击证人，他所帮助的会长，看起来也曾因为警察的包庇案件而去坐牢过（？）所以才会想要彻查所有在警界中那些不可告人的悬案。